陈玲^* , 陈越^* , 钟巧芳 , 王波 , 付坚 , 肖素勤 , 程在全 , 余腾琼^**

云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所,云南省农业生物技术重点实验室,农业部西南作物基因资源与种质创制重点实验室,昆明,650223
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 1 篇   
收稿日期: 2020年02月18日    接受日期: 2020年02月24日    发表日期: 2021年06月26日

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水稻抗白叶枯病基因Xa1 是一个能对日本白叶枯病优势小种产生专化抗性的R 基因，曾被广泛应用于水稻的抗性育种研究。为深入了解 Xa1家族成员及其特征，本研究通过生物信息学对 Xa1类成员进行系统鉴定，并分析其基本结构特征、染色体定位、序列变异以及系统进化关系等相关特性。结果显示，共鉴定到 34个成员，它们都来自稻属植物，这些成员成簇分布在水稻 4号染色体上。基本结构特征分析结果表明，Xa1家族成员的 DNA、mRNA和 CDS长度，以及内含子、外显子和氨基酸数量等偏差较大，但氨基酸残基组成差异不明显；多样性分析发现，氨基酸保守性低，密码子偏好性不强，核苷酸和氨基酸遗传变异较丰富，但大多的变异为无义突变；根据进化关系将家族成员分为五类，其中第五类成员包括LOC102719767 共 1个基因，它们位于系统树基部，为 Xa1类基因进化的祖先类群。本研究初步分析了 Xa1基因家族的特征，为后期从中发掘功能性抗白叶枯病基因提供理论支持。
 

水稻白叶枯病；Xa1基因家族；生物信息学；系统进化