研究报告

樟叶越桔过氧化氢酶VdCAT1基因克隆与生物信息学分析  

陈鹏吉1 , 李国泽1 , 邵亚林1 , 李雪1 , 赵平2 , 陆燕元3 , 丁勇1*
1西南林业大学,云南省高校林木生物技术重点实验室,昆明, 650224; 2西南林业大学,西南地区林业生物质资源高效利用国家林业与草原局重点实验室,昆明, 650224; 3西南林业大学林学院,昆明, 650224
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 10 篇   
收稿日期: 2020年02月13日    接受日期: 2020年02月19日    发表日期: 2021年06月02日
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摘要

作为植物抗氧化防御系统主要保护酶之一,过氧化氢酶在植物细胞响应逆境胁迫应答等方面发挥重要作用。本研究通过生物信息学分析RNA-Seq数据(NCBI登录号: PRJNA285946),结合RT-PCR技术首次从樟叶越桔成熟叶片中获得了过氧化氢酶基因VdCAT1全长为1 611 bp的cDNA序列,VdCAT1基因完整开放阅读框(ORF)长度为1 479 bp,推测编码的VdCAT1蛋白含492个氨基酸,相对分子量为56.96 kD,理论等电点(pI)为6.65,总平均疏水系数为-0.545,推测VdCAT1为无跨膜结构域、非分泌性亲水蛋白质。VdCAT1二级结构主要由随机卷曲和α-螺旋等构件组成。樟叶越桔VdCAT1基因编码的氨基酸序列与茶树CsCAT1和拟南芥AtCAT1等过氧化氢酶氨基酸序列具有较高的同源性和较近的亲缘关系。本研究结果为后期揭示VdCAT1基因的生理功能及其表达调控提供科学依据。

关键词
樟叶越桔;过氧化氢酶;VdCAT1 基因;生物信息学

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《分子植物育种》印刷版
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