李胜楠¹ , 梁华² , 丘帅¹ , 纪坤¹ , 王煜凯¹ , 杨馥熔¹ , 赵博文¹ , 李雪林^1*

1 河南科技大学农学院, 洛阳, 471023; 2 河南科技大学食品与生物工程学院, 洛阳, 471023
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 22 篇   
收稿日期: 2020年02月11日    接受日期: 2020年02月14日    发表日期: 2021年05月11日

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DNA 甲基化是表观遗传修饰的途径之一，在维持生物基因组稳定性与调控基因转录和表达中起着重要作用。为明确棉花愈伤组织分化过程中基因组 DNA 的甲基化变异模式以及甲基化图谱，本研究利用全基因组亚硫酸盐测序(WGBS)技术对棉花愈伤组织分化(非胚性与胚性)过程中的 DNA 甲基化模式进行了全面比较。全基因组 DNA 甲基化分析表明，在棉花愈伤组织分化过程中非胚性愈伤组织的 mCG 与 mCHG 所占比率高于胚性愈伤组织，而不对称 mCHH 的比率则低于胚性愈伤组织；非胚性愈伤组织的 mCG、mCHG、mCHH 及 mC 的平均甲基化水平均低于胚性愈伤组织。基因组甲基化区域分析表明，棉花愈伤组织分化过程中基因间、启动子和基因下游(转录终止位点下游 2 kb)的甲基化水平较高，同时胚性愈伤组织的基因间、启动子及基因下游的平均甲基化水平均高于非胚性愈伤组织。因此，本研究分析了棉花愈伤组织全基因组DNA 甲基化水平，为进一步研究棉花体细胞胚胎发生的表观遗传机制提供了依据。

DNA 甲基化；陆地棉；愈伤组织；表观遗传修饰