研究报告

玉米TPP家族基因生物信息学及表达分析  

张颖1 , 陈浩1 , 管淑君1 , 罗红兵1,2 , 邓敏1,2*
1湖南农业大学农学院,长沙, 410128; 2湖南省玉米工程技术研究中心,长沙, 410128
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 2 篇   
收稿日期: 2020年02月09日    接受日期: 2020年02月14日    发表日期: 2021年06月02日
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摘要

TPP是合成海藻糖的关键酶,广泛存在于各种植株中,可通过影响海藻糖的合成参与调控植株的抗逆体系。分析玉米中 TPP家族基因的性质和进化有利于进一步为玉米在逆境中的产量品质提高的研究奠定基础。本研究利用拟南芥的 9TPP家族基因,结合 BLASTPfamExPASyMEGA 6.0MEMETBtools等软件和网站,对玉米 TPP家族成员的基因位置、基因结构、蛋白质理化性质、保守基序、系统进化和基因表达模式进行分析。结果显示,根据 B73的完整基因组数据,在玉米基因组中共鉴定了 26TPP 基因,氨基酸数介于 2431 391之间,均为亲水性蛋白,且 64.5%的成员属酸性蛋白。除第 10号染色体外,玉米 TPP家族基因在其余染色体上均有分布。鉴定了 3个保守结构域,结合基因进化和基因结构分析,具有相同 motif的基因在进化和基因结构上相对一致。根据基因启动子顺式作用元件分析,ZmTPP11 可能与提高植株低温抗性有关,ZmTPP15可能与加速玉米机械损伤愈合有关。通过对玉米TPP基因表达模式分析,发现有 5TPP基因在各组织和发育时期均高表达,而共表达分析和 GO富集分析显示与ZmTPPs共表达的基因主要参与应激反应、信号传导、发育过程和生物调节等生物过程。研究结果为进一步研究玉米对逆境胁迫的响应和生长发育提供参考。
 

关键词
玉米;TPP基因家族;抗逆性;生物信息学;表达分析

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《分子植物育种》印刷版
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