周尧¹ , 孙超¹ , 张玉松¹ , 卢晨阳¹ , 杨进成 ² , 林良斌 ^1*

1云南农业大学农学与生物技术学院,昆明, 650201; 2云南省玉溪市农业科学院,玉溪, 653100
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 7 篇   
收稿日期: 2020年01月07日    接受日期: 2020年01月14日    发表日期: 2021年06月02日

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海藻糖磷酸合成酶(Trehalose phosphate synthetase,TPS)在植物中响应多种非生物胁迫及生物胁迫时起着重要的作用。但是，我们对甘蓝型油菜中TPS基因的了解知之甚少。本研究运用生物信息学方法在甘蓝型油菜基因组中筛选甘蓝型油菜TPS家族基因，对鉴定出的 31个BnTPSs基因进行分子特征、蛋白特性、蛋白结构域、保守基序、顺式作用元件、KaKs、染色体定位、系统进化树构建等研究。系统发育分析表明,BnTPS家族分为Ⅰ和Ⅱ类，家族成员数明显比甘蓝，白菜，和拟南芥中的TPS基因数多，并不规则分布于染色体上；多数蛋白呈酸性，分别在N端和C端具有TPS和TPP结构域；顺式作用元件分析表明，TPS家族与植株抗逆境胁迫有关；KaKs分析表明，大多BnTPSs家族成员有多拷贝基因，基因在纯化选择压力下进化本研究结果为进一步研究甘蓝型油菜 TPS家族基因生物学功能尤其在响应逆境中的功能奠定理论基础。

 

甘蓝型油菜；海藻糖磷酸合成酶基因家族；生物信息学分析