研究报告

基于转录组的甘蔗 ScJAZ 基因家族鉴定及表达分析  

娄文月1 , 孙婷婷1 , 岑光莉1 , 王文举1 , 尤垂淮2 , 苏炜华1 , 汪洲涛1 , 李大妹1 , 阙友雄1,3* , 苏亚春1,3*
1 福建农林大学, 农业部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室, 福州, 350002; 2 福建农林大学生命科学学院, 福州, 350002; 3 福建农林大学,教育部作物遗传育种与综合利用重点实验室, 福州, 350002
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 8 篇   
收稿日期: 2020年01月15日    接受日期: 2020年01月20日    发表日期: 2021年05月10日
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摘要

Jasmonate ZIM domain (JAZ)蛋白是茉莉酸信号转导途径的关键因子,参与植物抵御生物和非生物逆境胁迫信号的响应和调控。本研究基于课题组构建的多个甘蔗转录组数据库鉴定了 19 个具有完整编码区的甘蔗 ScJAZ 家族基因(ScJAZ15~ScJAZ33),并分析了相应编码蛋白的理化性质、结构特征、进化分类及在低温、低氮和叶枯病菌(Stagonospora tainanensis)胁迫下的基因表达模式。生物信息学分析显示,ScJAZ15~ScJAZ33 基因编码蛋白均属于不稳定亲水性的胞内非分泌蛋白,其氨基酸数目(94~426)和相对分子量(10 451.94~45 125.6 Da)差异较大,氨基酸序列的一致性仅为 18.09%,且蛋白磷酸化和糖基化潜在位点的数目各异。ScJAZ15~ScJAZ33 聚类在 JAZ 家族的 Group AGroup B Group C 三个不同的系统分支上,19 ScJAZ 成员均含有 JAZ 蛋白家族的两个典型保守结构域 Jas 基序和 TIFY motif 以及 1 个弱保守的 motif 3基序,但其他结构功能未明确的 motif ScJAZ15~ScJAZ33 蛋白中的数量和分布存在差异。对低温胁迫甘蔗后的转录组数据分析发现,ScJAZ17 基因在耐寒性强品种 FN39 中下调表达,但在耐寒性弱品种 ROC22中没有差异表达,推测 ScJAZ17 基因可能负向调节甘蔗对低温胁迫的应答反应。在低氮处理下,ScJAZ18ScJAZ19ScJAZ20 ScJAZ21 基因均无差异表达。受叶枯病菌侵染后,在胁迫早期,抗叶枯病品种 ROC22 中的 ScJAZ22 基因下调表达,而 ScJAZ24 ScJAZ30 基因上调表达,在胁迫中后期,ScJAZ22ScJAZ24 ScJAZ31 基因均上调表达;感叶枯病品种 FN12-047 中的 ScJAZ31 基因在病原菌侵染的早期和中后期均上调表达,ScJAZ28 基因则在病原菌侵染中后期上调表达,表明 ScJAZ22ScJAZ24ScJAZ28ScJAZ30 ScJAZ31在甘蔗应答叶枯病菌侵染过程中可能发挥积极调控作用。本研究结果为深入研究甘蔗 ScJAZ 家族基因的结构和功能提供参考。

关键词
甘蔗(Saccharum spp.);JAZ;基因家族;生物信息学分析;表达模式

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《分子植物育种》印刷版
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