1浙江大学生物系统工程与食品科学学院,杭州, 310058; 2塔里木大学生命科学学院,阿拉尔, 843300
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 13 篇
收稿日期: 2020年01月13日 接受日期: 2020年02月19日 发表日期: 2021年04月20日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 13 篇
收稿日期: 2020年01月13日 接受日期: 2020年02月19日 发表日期: 2021年04月20日
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摘要
梨是新疆地区栽培面积和产量较大、品种资源丰富的一类特色果树,具有重要的产业地位。为促进新疆特色梨从传统育种向分子遗传育种发展,迫切需要开展功能基因的挖掘。本研究以轮台句句梨、南果梨、香梨、鸭梨、圆黄、红茄等6种新疆特色梨果为材料,进行了无参转录组学分析,获得1 021 868 070条高质量clean read数据, 总碱基数为152 530 521 446 bp。Clean read经De novo组装后获得78 827条unigene。采用六大公共数据库作同源比对,注释到50 542个unigene。对unigene 作GO和KEGG功能分类,获得49个功能群和130个通路,确定了部分绿原酸合成途径的候选基因,并查找到17 416个SSR位点。本研究为新疆特色梨果功能成分绿原酸合成分子机理研究和遗传多样性分析提供了科学依据。
关键词
新疆梨果;转录组分析;功能注释
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