王文强¹ , 文豪¹ , 金强² , 俞文君² , 白红进² , 吴翠云² , 沈立荣^1*

1浙江大学生物系统工程与食品学院,杭州, 310058; 2塔里木大学植物科学学院,阿拉尔, 843300
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 1 篇   
收稿日期: 2020年01月10日    接受日期: 2020年01月17日    发表日期: 2021年04月06日

这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用，版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。

核桃(Juglans regia L.)是新疆的重要经济树种。为研究‘新温 81’(W81)、‘新温 179’(W179)和‘新萃丰’(X10) 3个新疆核桃品种差异的遗传基础，我们对 3种核桃仁的转录组进行了测序和分析。结果表明，所有样本与参考基因组比对后匹配率在 93%以上，共有 36 812个基因至少在六大数据库(NR, SwissProt, Pfam, COG, GO和 KEGG)中一个数据库获得注释，占总基因数目的 84.97%。分组比对显示，W81与 X10、W81与W179、W179与 X10间分别有 1 921、2 058和 1 253个差异表达基因。通过 GO功能注释显示，3个品种差异基因在生物过程、细胞组分和分子功能 3大类别均有分布，且分类结果相似。KEGG代谢通路富集分析表明，W81与 W179，W81与 X10间的差异基因主要富集在氨基酸代谢、脂肪酸合成与降解等代谢途径，W179与X10间仅在四条代谢途径有差异基因富集。本研究为培育优质核桃品种提供了科学依据。

新疆核桃；转录组；差异表达基因；功能注释