广西壮族自治区农业科学院经济作物研究所, 南宁, 530007
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 5 篇
收稿日期: 2020年01月13日 接受日期: 2020年02月17日 发表日期: 2020年07月15日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 5 篇
收稿日期: 2020年01月13日 接受日期: 2020年02月17日 发表日期: 2020年07月15日
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摘要
为研究间作甘蔗对花生相关基因的表达调控及响应机制,以花生叶片作为材料,使用 Illumina NovaSeq 6000 高通量测序技术,对间作花生离甘蔗较近的边行(IPA_leaf)、间作花生离甘蔗较远的中间行(IPB_leaf)及单作花生(MP_leaf)叶片进行转录组的测序分析。将各样本获得的转录组数据进行两两比较,MP_leaf_vs_IPA_leaf、MP_leaf_vs_IPB_leaf 和 IPB_leaf_vs_IPA_leaf 的差异表达基因数分别是 1 806 个、968个、1 302 个,其中上调表达基因分别占 61.13%、48.24%、65.05%。GO 功能富集分析显示差异表达基因主要涉及细胞壁组织或生物合成、碳水化合物生物合成与代谢过程、细胞多糖生物合成与代谢过程、细胞葡聚糖生物合成与代谢过程、催化活性、氧化还原酶活性及过程等。KEGG 富集分析表明差异表达基因主要涉及的代谢通路有苯丙素类生物合成、琢- 亚麻酸代谢、淀粉和蔗糖的代谢、类黄酮生物合成等。本研究通过花生叶片转录组分析,为研究间作花生叶片基因的表达调控机制提供基础数据资料。
关键词
花生;间作;转录组;差异表达基因
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