青岛农业大学园艺学院,青岛, 266109
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 11 篇
收稿日期: 2020年01月08日 接受日期: 2020年01月13日 发表日期: 2021年04月07日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 11 篇
收稿日期: 2020年01月08日 接受日期: 2020年01月13日 发表日期: 2021年04月07日
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摘要
WRKY基因家族是植物中最大的转录因子家族之一,在植物生长发育和抵御逆境胁迫中发挥重要作用。‘山定子’是中国重要的野生苹果属抗性种质资源,抗寒能力强。本研究通过生物信息学方法,较全面的比较了‘山定子’和栽培苹果‘GDDH13’两份材料中的 WRKY基因家族信息,结果显示:‘GDDH13’中WRKY 基因数量比‘山定子’多 7个,多出的 7个WRKY 基因分布在 GroupⅠ和 Group Ⅲ两个亚组中;通过比较发现‘山定子’和‘GDDH13’中的 WRKY结构域和基因结构在相近亚组内非常保守;发现‘山定子’的WRKY基因家族有更多的成员启动子区含有低温和干旱响应元件,这可能与‘山定子’抗逆性强有关;通过基因染色体位置和苹果基因组范围内对MdWRKY 基因进行的同线分析表明串联重复和部分重复,可能在苹果 WRKY基因家族的扩张和进化中发挥了重要的作用;通过器官特异性表达模式和果实发育过程表达分析,鉴定到MdWRKY64 和MdWRKY67 可能与苹果果实成熟密切相关;通过不定根发育过程的表达分析,筛选到 8个MdWRKY 基因可能参与苹果不定根的形成。本研究为苹果WRKY 基因的进化提供了一些数据,并为苹果WRKY 基因的功能鉴定提供了参考,进一步为苹果的分子育种提供了帮助。
关键词
山定子(Malus baccata);GDDH13;WRKY;基因表达;生物信息学分析
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