王攀 , 蔡兆明 , 廖静静 , 罗路云 , 向美琴 , 石家宇 , 许丹 , 夏秋宇 , 王殿东^*

长江师范学院现代农业与生物工程学院,重庆, 408100
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 7 篇   
收稿日期: 2019年12月31日    接受日期: 2020年01月03日    发表日期: 2021年03月15日

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为明确大白菜NPR 转录辅助因子在大白菜基因组中的数量、结构和表达特点，揭示NPR 在水杨酸信号途径调控大白菜生长发育过程中的作用。本研究利用拟南芥资源信息库 TAIR10和芸薹属基因组网站Brassica Database鉴定大白菜基因组中的NPR 家族成员，并对其蛋白和基因特性进行生物信息学分析。鉴定出大白菜基因组中包括 11个NPR 家族基因，分别定位在大白菜 7条染色体上，具有 1~5个外显子不等。BrNPR家族蛋白可聚类为 6个分支，包含 11个保守元件，并且所有 BrNPR家族成员均含有 DUF和 Ank两个保守结构域，其中BrNPR1-4 成员基因的编码区均含有核定位信号(NLS)。基因表达模式检测结果表明部分大白菜NPR 基因在不同组织中具有组织特异的表达模式，BrNPR1B 在根、茎和叶及BrNPR3B 在花和种荚中表达显著，绝大部分BrNPR 基因受盐胁迫诱导表达，部分BrNPR 基因受根肿菌侵染诱导表达。本研究可为后续大白菜NPR 基因的功能验证提供依据。

大白菜；水杨酸；NPR 家族基因；基因表达；根肿菌