刘小红^*

西华师范大学生命科学学院, 南充, 637002
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 18 篇   
收稿日期: 2019年12月26日    接受日期: 2020年01月09日    发表日期: 2021年03月22日

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高温已对玉米(Zea mays L.)生产造成了巨大危害。为了给耐高温胁迫玉米品种选育提供可用的分子遗传标记，本研究以耐高温和高温敏感的两个玉米品种为实验材料，通过花粉总RNA提取、mRNA纯化、反转录、转录组文库构建及测序等工作，最后对获得的转录组数据进行SNP和InDel分子标记分析。结果显示：高质量碱基数据量平均为6.69 Gb，占原始数据比例平均达94.71%；在SNP分子标记中，Homo位点平均为19 450个，Hete位点平均为23 598个，转换类型共52 337个，颠换类型共27 868个；在InDel分子标记中，Homo位点平均为1 023个，Hete位点平均为1 736个；SNP/InDel位点在外显子区分布最多，达到总量的58.02%，其次是基因间隔区、3’非翻译区和5’非翻译区，其余区域位点占总量比例均低于5%；SNP/InDel造成同义单核苷酸突变比例最高，平均值为60.69%，其次为非同义单核苷酸突变，平均值为36.72%，非移码替换突变为平均值1.64%，其余三种均不到1.00%；在SNP和InDel标记位点基因功能注释中，NR数库注释最多，超过8 000个，其次为KEGG和eggNOG；注释到GO和Swissprot数据库的相对较少。本研究结果为进一步标记辅助耐高温玉米品种选育提供了分子基础，也为其它植物的类似研究提供了参考。

玉米(Zea mays L.)； 分子标记；高温胁迫；转录组