王军¹ , 徐详² , 杨杰¹ , 王芳权¹ , 范方军¹ , 朱金燕¹ , 李文奇¹ , 仲维功¹

1 江苏省农业科学院粮食作物研究所, 国家水稻改良中心南京分中心, 南京, 210014;
2 扬州大学生物技术学院, 扬州, 225009
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2014 年, 第 12 卷, 第 6 篇   doi: 10.13271/j.mpb.012.001097
收稿日期: 2014年02月26日    接受日期: 2014年08月01日    发表日期: 2014年08月23日

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推荐引用：

 Wang J., Xu X., Yang J., Wang F.Q., Fan F.J., Zhu J.Y., Li W.Q., and Zhong W.G., 2014, Sequence Analysis of Genes Associated with Seed Shattering of Weedy Rice in Region of Jiangsu and Northeast of China, Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 12(6): 1097-1102 (王军, 徐详, 杨杰, 王芳权, 范方军, 朱金燕, 李文奇, 仲维功, 2014, 江苏省和东北地区杂草稻落粒性基因的序列分析, 分子植物育种, 12(6): 1097-1102)

杂草稻是指在稻田中和稻田周边生长的具有杂草特性的半野生稻，中国大部分稻区都受到了杂草稻不同程度的危害，其中，以江苏省和东北地区危害最为严重。为了探明江苏省和东北地区杂草稻落粒性的基因型，为研究杂草稻的落粒性提供依据，本研究根据已经报道的水稻落粒性基因qSH1、SH4的功能区设计引物，对来源于江苏省、黑龙江省、吉林省和辽宁省的33份落粒性强的杂草稻进行PCR扩增，通过测序分别得到2个片段长度约500 bp、600 bp的功能区核苷酸碱基序列。将获得的序列与GenBank中序列进行比对分析，结果表明：33份杂草稻与水稻在qSH1功能区存在1个碱基位点变异，经证实为前人报道的SNP位点，另外有3份杂草稻在qSH1功能区下游存在1个位点碱基变异，但不能确定是否为一个新的功能区；33份杂草稻与水稻在SH4功能区序列完全一致。研究结果说明江苏省和东北地区杂草稻的落粒性是由qSH1控制的，与SH4无关。

杂草稻；落粒性；qSH1；SH4；序列分析