研究报告

节瓜SCoT分析体系的建立与优化  

杜旋1 , 鲁博2 , 刘娜1*
1 上海市农业科学院设施园艺研究所, 上海市设施园艺技术重点实验室, 上海, 201403; 2 上海市农业科学院农业科技信息研究所, 上海, 201403
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 27 篇   
收稿日期: 2019年12月16日    接受日期: 2019年12月20日    发表日期: 2021年09月15日
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摘要

为了获得适用于节瓜 SCoT-PCR 反应的反应体系以及适用于该体系的 SCoT 引物,首先利用正交实验的方法对节瓜 SCoT-PCR 反应体系的三因素(模板, 2sanTaq PCR mix 预混液, 引物)的工作浓度进行优化。然后利用优化的节瓜 SCoT-PCR 反应体系对 36 SCoT 引物进行筛选,首次筛选到应用于节瓜中的SCoT 引物,并对部分引物的退火温度进行优化。通过分析,确定了节瓜 SCoT-PCR 反应体系是 DNA 模板(25 ngL) 2.5 L2SanTaq PCR mix 预混液 11 L、引物(10 μmol/L) 2 L,筛选到了 14 条适合在节瓜的ISSR-PCR 反应中应用的引物以及得到了它们的最适退火温度。与此同时,经验证该体系在节瓜应用具有良好的适用性、可靠性和稳定性。
 

关键词
节瓜; SCoT -PCR; 正交设计;引物筛选;退火温度

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《分子植物育种》印刷版
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