研究报告

基于 RNA-seq技术的水杉半胱氨酸合成酶基因的克隆分析  

何道文1 , 龙珏洁1 , 赵欢1 , 廖昌敏2 , 刘小红1*
1西华师范大学,西南野生动植物资源保护教育部重点实验室,南充, 637002; 2西华师范大学图书馆,南充, 637002
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 15 篇   
收稿日期: 2019年12月12日    接受日期: 2019年12月19日    发表日期: 2021年03月16日
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摘要

水杉(Metasequoia glyptostroboides)是世界著名的孑遗植物,但对其在分子水平研究的报道极少。为了获得与耐逆境胁迫有关的半胱氨酸合成酶基因,本研究以水杉原生种为实验材料,基于高通量转录组测序(high-throughput mRNA sequencing, RNA-seq)技术从全长转录组文库中克隆了一个半胱氨酸合成酶基因(MeGl-CSase),并对该基因作了进一步的生物信息学分析。结果表明,MeGl-CSase 基因的全长 cDNA1 702 bp,编码长度为 465个氨基酸的半胱氨酸合成酶蛋白;该蛋白的分子量为 49 471.35 Da,总平均吸水值为 -0.071,等电点为 7.95;含有 39个常见功能位点;二级结构包括 11个折叠区、21个螺旋区以及一些卷曲区;三级结构预测结果进一步证明MeGl-CSase 基因编码的产物是真核生物半胱氨酸合成酶蛋白。本研究结果可为水杉及其它物种的半胱氨酸合成酶蛋白基因的结构和功能研究提供参考。

关键词
水杉(Metasequoia glyptostroboides);半胱氨酸合成酶;基因;生物信息学

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《分子植物育种》印刷版
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