研究报告

基于重测序的芥蓝(Brassica alboglabra)全基因组InDel标记开发  

洪晓如1,2,3 , 吴智明1 , 陈汉才2,3 , 黎庭耀2,3 , 沈卓2,3 , 张艳2,3*
1 仲恺农业工程学院园艺园林学院, 广州, 510225; 2 广东省农业科学院蔬菜研究所, 广州, 510640; 3 广东省蔬菜新技术研究重点实验室, 广州,510640
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 19 篇   
收稿日期: 2019年12月09日    接受日期: 2020年12月18日    发表日期: 2021年03月22日
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摘要

碱基插入/缺失(InDel)在基因组中的分布密度仅次于SNP且易于基因型分型,成为分子标记开发的主要来源。为了开发芥蓝品种间有多态性的分子标记,本研究利用2份芥蓝自交系重测序数据鉴定的InDel位点,在全基因组范围内设计了367对InDel候选标记。通过PCR检测比较8个芥蓝自交系的多态性,发现284对标记在至少2个芥蓝自交系间有多态性,阳性率为77.4%。本研究利用重测序技术开发芥蓝品种间InDel标记效率较高,为种质资源分析、基因定位、分子标记辅助育种等提供了便捷工具。

关键词
芥蓝(Brassica alboglabra);重测序; InDel 标记

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《分子植物育种》印刷版
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