研究报告

芍药等 8 种植物 COMT 基因的生物信息学分析  

许聪 , 石文波 , 高天祥 , 胡蕴钰 , 陶俊 , 赵大球
扬州大学园艺与植物保护学院, 扬州, 225009
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 7 篇   
收稿日期: 2019年12月10日    接受日期: 2020年01月07日    发表日期: 2020年04月30日
© 2020 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台
这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用,版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。
摘要

植物咖啡酸 -O- 甲基转移酶(caffeic acid O-methyltransferase, COMT)基因对木质素的合成具有重要的调控作用。本研究采用生物信息学方法对芍药等 8 种植物 COMT 基因编码的氨基酸序列进行比对,进而对其蛋白理化性质、信号肽、跨膜结构域、磷酸化位点、亚细胞定位、二级结构与三级结构进行了预测与分析。结果表明,芍药等 8 种植物 COMT 基因编码氨基酸的一致性可达 65.91%,平均相对分子量为 39 437.79 Da,带有酸性等电点,含量最丰富的氨基酸为亮氨酸(Leu)和丙氨酸(Ala),无信号肽,无跨膜结构域,磷酸化位点数量最多的为丝氨酸和苏氨酸,定位于细胞骨架和细胞质中可能性最大,二级结构则以 α- 螺旋和无规则卷曲为主,三维结构具有一定的相似性。这一结果为今后深入开展植物 COMT 基因功能研究提供了科学依据。

关键词
芍药;咖啡酸 -O- 甲基转移酶;生物信息学;木质素

HTML格式版本正在制作中。
《分子植物育种》印刷版
• 第 18 卷
阅览选项
. 全文 PDF
. 全文 HTML
读者评论
. 评论
作者的其他论文
.
许聪
.
石文波
.
高天祥
.
胡蕴钰
.
陶俊
.
赵大球
相关论文
.
芍药
.
咖啡酸 -O- 甲基转移酶
.
生物信息学
.
木质素
服务
. 发表评论