研究报告

基于表型数据的菊芋核心种质初步构建  

侯志强 , 王丽慧 , 赵孟良 , 杨世鹏 , 孙雪梅 , 高洁铭 , 钟启文*
青海大学农林科学院, 青海省蔬菜遗传与生理重点实验室, 西宁, 810016
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 41 篇   
收稿日期: 2019年12月05日    接受日期: 2019年12月25日    发表日期: 2021年09月16日
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摘要

为更好地保存、研究和利用现有菊芋种质资源,本研究以 250 份种质材料的 19 个表型性状数据为基础,采用逐步系统聚类并优化聚类和取样方法,初步构建遗传冗余少、代表性强的菊芋核心种质。结果表明,在 25%取样比例下多种系统聚类方法抽取的核心种质中,以最短距离法(C4)和优先取样法(S3)组合的C4S3 方法所抽取的核心种质评价参数优于其他方法,对原种质的代表性最强。在 C4S3 法下优化取样比例,结果显示最合适的取样比例为 20%,所抽取的核心种质 C4S3-20 用较少的材料获得了较高的遗传代表性。在 C4S3-20 方法下继续进行分组取样,评价参数表明分组取样效果不如整体取样,因而不予采纳。主成分分析显示 C4S3-20 保留了原种质的主成分,去掉了原种质的遗传冗余。最终获得了菊芋核心种质 C4S3-20,包括 50 份材料,其与原种质的性状均值差异百分率为 0%,方差差异百分率 63.63%,极差符合率为 100%,变异系数变化率为 131.38%,表型保留比例为 96.15%Shannon 多样性指数为 1.595。本研究发现该核心种质很好地代表了原种质的遗传多样性,在一定程度上为菊芋资源的有效利用奠定了基础。
 

关键词
菊芋(Helianthus tuberosus);核心种质;表型数据; 系统聚类; 遗传多样性

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《分子植物育种》印刷版
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