郭俊^1,2 , 朱婕^1,2 , 谢尚潜^1,3 , 张叶 ^1,2 , 叶蓓蕾 ^1,2 , 郑丽燕^1,2 , 凌鹏^1,3*

1 海南大学, 热带特色林木花卉遗传与种质创新教育部重点实验室, 海口, 570228; 2 海南大学园艺学院, 海口, 570228; 3 海南大学林学院, 海口,570228
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 25 篇   
收稿日期: 2019年12月03日    接受日期: 2019年12月13日    发表日期: 2020年12月09日

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本研究通过对‘哈斯’(Hass)与‘福尔特’(Fuerte) 2 个油梨品种转录组中 SSR 位点特征进行比较分析，设计引物并验证其多态性，为油梨开发新的 SSR 分子标记提供数据基础。利用 MISA 软件分别从油梨品种‘Hass’和‘Fuerte’的转录组数据中发现 SSR 序列 6 449 个和 6 312 个。统计结果显示，二核苷酸重复类型数量最多，占‘Hass’和‘Fuerte’SSR 总数的 48.44%和 48.32%，AG/CT 为出现频率最高的核苷酸重复基元，在‘Hass’中共 2 477 个(38.41%)，在‘Fuerte’中共 2 478 个(39.26%)；各核苷酸重复类型在 5 次重复中出现的次数最多，‘Hass’品种中为 1 539 次，占比为 23.86%，在‘Fuerte’中为 1 543 次(24.45%)；两个品种最优势的10 个微卫星类型相同； ‘Hass’品种特有重复基元 26 种， ‘Fuerte’品种特有重复基元 32 种。用 Primer 3.0 软件为‘Hass’、 ‘Fuerte’油梨转录组 SSR 序列成功设计出 13 686、13 398 对引物。随机选择 25 对引物对 8 份油梨种质资源进行多态性检测，分别得到 11 和 10 对多态性引物，多态性比率分别为 44%和 40%。本研究结果表明，两个油梨品种微卫星分布特征基本一致，油梨转录组可作为开发 SSR 分子标记的有效来源，得到的大量SSR 标记可为油梨的遗传多样性分析、亲缘关系鉴定及分子标记育种提供理论依据。
 

油梨(Persea americana Mill.)；转录组；SSR 信息；多态性；分子标记