研究报告

葡萄CHX 基因家族全基因组鉴定及生物信息学分析  

杜宜洋1 , 连红娟1 , 李晓梅2 , 谭敏2 , 杨镕兆2 , 刘政海2 , 杨兆亮2 , 唐晓萍2 , 董志刚1,2* , 李捷1,3*
1山西农业大学园艺学院,太谷, 030801; 2山西省农业科学院果树研究所,太原, 030031; 3山西省农业科学院园艺研究所,太原, 030031
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 8 篇   
收稿日期: 2019年11月26日    接受日期: 2019年11月25日    发表日期: 2021年01月20日
© 2020 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台
这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用,版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。
摘要

CHX(Cation/H+ exchanger, CHX)基因家族是CPA(Cation proton antiporter, CPA)基因家族的一个亚家族,家族基因广泛参与维持植物体内Na+/K+离子平衡的调控过程,对植物维持细胞离子浓度、花器官的发育起着至关重要的作用。本研究以葡萄(Vitis vinifera)为材料,共鉴定出19个VvCHX基因,命名为VvCHX1VvCHX19。本研究运用生物信息学的方法,系统地分析了葡萄VvCHXs基因的结构、蛋白理化性质、保守基序、系统进化,同源基因分析和组织特异性表达。结果表明,根据多物种CHX蛋白的进化树分析将19个VvCHX家族成员划分为4类; VvCHX家族基因不均匀的分布于7条染色体上,其中3对基因存在串联重复现象;同源基因分析表明,葡萄VvCHX家族成员可能在维持离子浓度、花器官发育中起到重要作用;组织特异性表达分析表明,绝大多数葡萄VvCHX基因家族成员在雄蕊、花粉、花中表达量较高。本研究结果为进一步探究CHX基因家族调控植物抗逆的分子机制提供依据。
 

关键词
葡萄;CHX基因家族;全基因组鉴定;生物信息学

HTML格式版本正在制作中。
《分子植物育种》印刷版
• 第 18 卷
阅览选项
. 全文 PDF
. 全文 HTML
读者评论
. 评论
作者的其他论文
.
杜宜洋1
.
连红娟1
.
李晓梅2
.
谭敏2
.
杨镕兆2
.
刘政海2
.
杨兆亮2
.
唐晓萍2
.
董志刚1,2*
.
李捷1,3*
相关论文
.
葡萄
.
CHX基因家族
.
全基因组鉴定
.
生物信息学
服务
. 发表评论