研究报告

不同北美鹅掌楸无性系响应淹水胁迫转录因子的鉴定及表达分析  

谭胤静1 , 孙小艳1,2* , 伍祎翌2 , 李晓晖2 , 辛在军2
1江西省科学院生物资源研究所,南昌, 330096; 2江西省科学院流域生态研究所,江西省重金属污染生态修复工程技术研究中心,南昌, 330096
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 12 篇   
收稿日期: 2019年11月21日    接受日期: 2019年11月26日    发表日期: 2021年01月20日
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摘要

北美鹅掌楸是优良的绿化和用材树种,但不耐水涝的特性严重影响其在季节性淹水地区的推广种植。利用新一代Illumina HiSeqTM PE100高通量转录组测序技术,本研究对1个耐淹无性系和1个淹水敏感无性系淹水胁迫4 d下的叶片的转录因子基因进行了鉴定。结果表明,转录组测序共获得214 161 Unigene 序列,鉴定出77个转录因子家族。不同无性系淹水胁迫后转录因子表达存在差异。在耐淹无性系中,检测到淹水后差异表达基因上调基因数量2015个,转录因子103 个,差异基因下调表达的数量1793个,转录因子基因91 个;而在淹水敏感无性系检测到的10 389个差异表达基因中,上调表达的转录因子217个,下调表达的转录因子191 个。MYBZinc fingerNACOrphansWRKYHomebox domainAP2 domainbHLHAUX/IAA family9个家族是北美鹅掌楸淹水后差异表达基因数量最多,表达量变化最显著的转录因子家族。本研究初步分析了淹水环境下不同北美鹅掌楸无性系转录因子的特征表达谱,为进一步研究响应淹水胁迫的转录因子的调控机制提供了参考。

关键词
北美鹅掌楸无性系;转录因子;转录组;淹水胁迫

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《分子植物育种》印刷版
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