研究报告

紫花苜蓿MsGT6的生物信息学及其逆境胁迫下表达分析  

项继红 , 宋婷婷 , 袁玉莹 , 孙雪 , 喻金秋 , 李佳玮 , 崔国文*
东北农业大学动物科学技术学院, 哈尔滨, 150030
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 16 篇   
收稿日期: 2019年11月11日    接受日期: 2019年11月18日    发表日期: 2021年01月02日
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摘要

GT6 基因属于 Trihelix 转录因子家族,该家族在调节植物生长发育及应答逆境胁迫等方面发挥着重要作用。为了明确紫花苜蓿 Trihelix 家族成员的基本特征及其在逆境胁迫下的响应,本研究利用生物信息学方法从蒺藜苜蓿数据库中鉴定出 41 Trihelix 成员,并对其进行染色体定位、系统进化树和保守基序分析。结果表明,Trihelix 家族成员不均匀分布在 8 条染色体上,其中 MtGT6 定位在 1 号染色体上,其分子量为 64.373 kD,等电点为 5.895,属于亲水性蛋白;亚细胞定位预测显示该基因位于细胞核;对 MtGT6 启动子顺式作用元件分析,发现启动子区域存在多种顺式作用元件,推测其能在多种逆境中响应;qRT-PCR 分析表明,该基因对盐碱响应更为明显。
 

关键词
紫花苜蓿(Medicago sativa L.);生物信息学分析;逆境胁迫;表达分析

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《分子植物育种》印刷版
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