研究报告/Research Report

现代月季Ty1-copia类逆转座子逆转录酶序列的克隆及分析  

李文天 , 杨涛 , 张晓莹 , 陈帅 , 李洲 , 车代弟
东北农业大学园艺学院, 哈尔滨, 150030
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2014 年, 第 12 卷, 第 23 篇   doi: 10.13271/j.mpb.012.001216
收稿日期: 2014年02月08日    接受日期: 2014年03月28日    发表日期: 2014年06月01日
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推荐引用:

Li W.T., Yang T., Zhang X.Y., Chen S., Li Z., and Che D.D., 2014, Cloning and Analysis of Ty1-copia-like Reverse Transcriptase in Mordern Rose, Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 12(6): 1216-1221 (李文天, 杨涛, 张晓莹, 陈帅, 李洲, 车代弟, 2014, 现代月季Ty1-copia类逆转座子逆转录酶序列的克隆及分析, 分子植物育种, 12(6): 1216-1221)

摘要

本研究以8个现代月季品种为试验材料,根据Ty1-copia类逆转座子逆转录酶的保守区设计简并引物,通过PCR扩增,从现代月季基因组中扩增出260 bp左右的目标条带。将扩增产物纯化后克隆于pMD 18-T质粒载体,选择阳性克隆,再经菌落PCR鉴定、测序及序列分析,获得19条来源于现代月季的Ty1-copia类逆转座子逆转录酶序列。研究发现这些序列的核苷酸长度集中于258~268 bp,存在较高的异质性,同源性范围3.4%~81.6%,主要表现在缺失突变,通过核苷酸聚类分析分为四类家族。翻译成氨基酸后,发现存在移框突变和终止密码子突变的现象,将这19条来源于现代月季的逆转录酶序列与登录在NCBI上来自于其它植物的Ty1-copia类逆转座子逆转录酶的氨基酸序列聚类分析,结果表明现代月季与其它物种间具有较高的同源性,表明Ty1-copia类逆转座子逆转录酶序列在不同物种之间可能存在横向传递。

关键词
现代月季;Ty1-copia类逆转录转座子;逆转录酶;异质性

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《分子植物育种》印刷版
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