研究报告

粗山羊草响应盐胁迫转录组分析  

施田野1 , 顾宇蓝1 , 张磊1 , 尹华燕2 , 唐恒2 , 平艳飞1 , 穆如宇2 , 穆可卿3 , 张文文1 , 侯文倩1*
1 江苏师范大学生命科学学院, 徐州, 221116; 2 山东农业大学农学院, 泰安, 271018; 3 潍坊学院生物与农业工程学院, 潍坊, 261061
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 13 篇   
收稿日期: 2019年10月26日    接受日期: 2019年11月01日    发表日期: 2020年12月08日
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摘要

利用转录组测序(RNA-Seq)技术对粗山羊草‘AL8/78’在 200 mmol/L NaCl 人工模拟盐胁迫 0 h 96 h 进行了转录组分析。结果表明:盐胁迫处理下上调和下调表达的差异表达基因(DEGs)分别为 546 个和876 个;GO 富集分析发现,DEGs 主要集中在代谢过程、细胞过程、细胞连接、催化活性等生物过程;KEGG富集分析发现,DEGs 主要富集在苯丙酮生物合成、类黄酮生物合成、植物激素信号转导等信号通路。通过对DEGs 进行转录因子注释,共注释到 41 个转录因子,主要包括 WRKYMYBbHLHNAC HSP 等类型。利用实时荧光定量 PCR (qRT-PCR)DEGs 进行了表达模式验证,发现其与 RNA-Seq 测序结果一致,证明了RNA-Seq 结果的准确性。本研究为挖掘粗山羊草耐盐基因提供了理论基础。
 

关键词
粗山羊草(Aegilops tauschii);盐胁迫;转录组

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《分子植物育种》印刷版
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