研究报告

西红花实时定量PCR内参基因筛选  

周琳1 , 蔡友铭 1 , 杨柳燕1 , 赵冰雪1,2 , 李芳1,3 , 张永春 1* ,
1 上海市农业科学院林木果树研究所, 上海市设施园艺技术重点实验室, 上海, 201106; 2 上海应用技术大学生态技术与工程学院, 上海,201418; 3 安顺学院农学院, 安顺, 561000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 25 篇   
收稿日期: 2019年10月18日    接受日期: 2019年10月22日    发表日期: 2020年12月11日
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摘要

为筛选西红花不同组织间稳定表达的最佳内参基因,以西红花的根、球茎、主芽、花丝、叶片、侧芽共6 个组织为试验材料,运用实时荧光定量 PCR 方法分析了 18S 核糖体 RNA (18S rRNA)、肌动蛋白基因(ACT)、转录延伸因子 -1(EF1琢)3- 磷酸 - 甘油醛脱氢酶基因(GAPDH)、微管蛋白基因(TUB)和多聚泛素基因 (UBQ) 6 个内参基因在不同组织中的表达差异情况。基于 Ct 值,利用 geNormNormFinder BestKeeper 分析 6 个内参基因表达稳定性。结果表明,3 个软件筛选出的最佳内参基因略有不同。综合分析结果
显示,
GAPDH UBQ 表达较为稳定,其次为 18S rRNA ACT,而 EF1琢 TUB 不适合作为西红花不同组织的内参基因。本研究确定西红花 qRT-PCR 分析的合适内参基因为 GAPDH UBQ,可用于种球发育、花发育、次生代谢产物形成和积累等机理研究。
 

关键词
西红花(Crocus sativus);不同组织;内参基因;实时荧光定量 PCR

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《分子植物育种》印刷版
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