研究报告

芸薹属VFB4基因家族的生物信息学分析  

郑孝民 , 陆俊杏 , 唐蓓 , 龚慧明*
重庆师范大学生命科学学院, 油用牡丹种质资源创新与利用重点实验室, 重庆, 401331
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 8 篇   
收稿日期: 2019年09月27日    接受日期: 2019年10月03日    发表日期: 2021年03月14日
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摘要

为了探究芸薹属甘蓝型油菜(B. napus)、白菜(B. rapa)、甘蓝(B. oleracea) 3 个物种的进化关系,本研究利用生物信息分析学的方法,测定芸薹属 VFB4 基因成员的氨基酸序列,染色体定位和二级结构。利用 VFB4基因在染色体上的位置,绘制出染色体定位图和 3 个物种的进化系统发育树,并对 3 个物种的亲缘关系进行讨论。结果显示,芸薹属 VFB4 基因编码的氨基酸数在 524~534 之间,均为亲水蛋白,亚细胞定位均在细胞核中。VFB4 基因不含内含子,GC 含量很高,但是在染色体上分布不均匀。系统进化发育树分析得出,芸薹属物种间的同源性非常的高,种内的同源性不是很高。通过对基因的对比分析发现,芸薹属 VFB4 位点符合禹氏三角理论,但是不完全符合芸薹属三倍体进化学说。本研究结果可为进一步研究芸薹属基因进化提供科学依据。
 

关键词
芸薹属物种; VFB4;分子进化; 保守性

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《分子植物育种》印刷版
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