研究报告

大麦基因组 GRAS 基因家族的全基因组鉴定与表达分析  

孔豆豆1,2 , 毛成志1,2 , 王蕾1,3 , 王寒冬1,3 , 张怀刚1,3 , 徐金青1,3* , 沈裕虎1,3*
1 中国科学院西北高原生物研究所, 中国科学院高原适应与进化重点实验室, 青海省作物分子育种重点实验室, 西宁, 810001; 2 中国科学院大学生命科学学院, 北京, 100049; 3 中国科学院种子创新研究院(筹), 西宁, 810001
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 3 篇   
收稿日期: 2019年09月24日    接受日期: 2019年10月01日    发表日期: 2021年01月25日
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摘要

GRAS 基因家族是一类仅存在于植物并广泛参与其生长发育调控的转录因子,根据其序列结构和系统发育树分化特征,GRAS 转录因子包含 PATI, DELLA, HAM, SCR, SHR 等多个亚家族成员。本研究利用大麦最新的基因组数据库,采用生物信息学的方法筛选鉴定出 41 GRAS 基因序列,其中有 34 条序列具有完整的 GRAS 家族蛋白特有的 GRAS 结构域,可定位到大麦 7 条染色体上且呈不均匀分布。与拟南芥和水稻 GRAS 蛋白进行的系统发育分析,可将大麦 GRAS 家族蛋白进一步划分为 10 个亚家族。本研究对大麦GRAS 基因的表达丰度分析,发现部分基因在发育阶段高表达,这可能暗示着这些基因在相应发育阶段起到重要作用。本研究结果可为后续挖掘和验证大麦 GRAS 基因提供参考。

关键词
大麦(Hordeum vulgare L.);GRAS 基因家族;系统发育分析;表达谱分析

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《分子植物育种》印刷版
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