项蕾蕾 , 孙雪丽 , 刘范 , 田娜 , 付帅 , 程春振 , 王天池^* , 赖钟雄^*

福建农林大学园艺植物生物工程研究所, 福州, 350002
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 1 篇   
收稿日期: 2019年09月17日    接受日期: 2019年09月27日    发表日期: 2020年12月07日

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为了解香蕉 MaHY5 基因密码子的使用特性，本研究利用生物信息学工具，分析了香蕉 MaHY5 基因的密码子使用偏好性，并分别与其它 31 个物种的 HY5 基因以及模式生物基因组进行比较。结果显示，香蕉 MaHY5 基因密码子选择偏好性弱且偏好以 G/C 结尾；自然选择的作用对香蕉 MaHY5 密码子偏性影响最大；多数双子叶植物 HY5 密码子可能偏好 A/T 结尾，而单子叶植物 HY5 密码子可能偏好 G/C 结尾；基于HY5 的 CDS 序列聚类结果比密码子使用频率分类结果更能反映物种间的进化规律；大肠杆菌原核表达系统更适用于香蕉 MaHY5 的异源表达试验，拟南芥可能为香蕉 MaHY5 转基因的最为理想受体。本研究分析了香蕉 MaHY5 基因及其他物种中 HY5 基因的密码子偏好性与进化关系，同时筛选最适合 MaHY5 基因异源表达宿主及遗传转化受体，为深入探究 MaHY5 基因的功能提供理论基础。
 

香蕉；HY5 基因；密码子偏好性；基因功能