廖昌敏 ² , 张咏祀¹ , 刘小红^1* , 魏村雪¹

1 西华师范大学生命科学学院, 野生动植物资源保护教育部重点实验室, 南充, 637002; 2 西华师范大学图书馆, 南充, 637002
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 12 篇   
收稿日期: 2019年09月14日    接受日期: 2019年09月20日    发表日期: 2020年12月08日

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水杉(Metasequoia glyptostroboides)是全世界著名的孑遗植物，而核糖体蛋白又是细胞中参与蛋白质合成及调控基因表达的一种重要蛋白。因此，为了进一步展开对水杉核糖体蛋白基因的结构和功能研究，本研究在构建水杉全长转录组文库的基础上，克隆了一个 40S 核糖体蛋白 S8 基因(MgRPS8)，借助于生物信息学手段对其进行了分析。结果显示：该基因 cDNA 全长为 1 497 bp，编码 221 个氨基酸；编码蛋白分子量为25.1 kD，等电点为 10.39，总平均吸水值为 -0.968；含有 19 个常见功能位点；二级结构包括 5 个螺旋区、7 个折叠区和一些无规则卷曲区；三级结构同源比对的结果进一步证实该基因的编码蛋白为真核生物核糖体蛋白 S8；系统发育树构建的结果表明，该基因与日本柳杉的 40S 核糖体蛋白 S8 基因具有较近的亲缘关系。本研究结果可为水杉及其它物种的核糖体蛋白基因的结构和功能研究提供分子基础参考。
 

水杉(Metasequoia glyptostroboides)；基因克隆；生物信息学分析