研究报告

西伯利亚杏全基因组MADS - box基因家族鉴定及表达分析  

陈晨1,2 , 朱高浦1 , 赵罕1 , 刘慧敏1 , 罗颖1 , 徐宛玉1 , 黄梦真1 , 乌云塔娜 1* , 王淋 1*
1 中国林业科学研究院, 经济林研究开发中心, 国家林业和草原局泡桐研究开发中心, 经济林种质创新与利用国家林业和草原局重点实验室,郑州, 450003; 2 南京林业大学林学院, 南京, 210037
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 1 篇   
收稿日期: 2019年09月27日    接受日期: 2019年10月04日    发表日期: 2020年11月03日
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摘要

MADS-box 转录因子在调控植物生长发育中具有重要的作用,为了探明 MADS-box 基因家族在西伯利亚杏(Prunus sibirica)的功能,本研究基于西伯利亚杏基因组数据,对西伯利亚杏 MADS-box 基因(PsMADS-box)进行鉴定并对其基因结构、染色体分布、系统进化和表达模式进行分析。结果表明,在西伯利亚杏基因组中共鉴定得到 72 个 PsMADS-box 基因,其中 36 个 TypeⅠ型 MADS-box 基因,包含 3 个亚家族,36 个 Type Ⅱ型 MADS-box 基因,包含 14 个亚家族;PsMADS-box 基因不均匀地分布于西伯利亚杏的 8 条染色体上;基因结构分析表明,Type Ⅱ型 MADS-box 基因的内含子数量较多;表达模式分析显示 PsMADSbox 基因家族成员具有不同的表达模式,其中多数 TypeⅠ型 MADS-box 基因在叶片、花芽、花、果实、种仁、萼片、花瓣、雌蕊、雄蕊中表达量极少甚至不表达;MIKCc 型 MADS-box 基因在不同的组织中存在特异表达。本研究将为解析西伯利亚杏花器官发育的分子机制提供重要的理论依据。

关键词
西伯利亚杏(Prunus sibirica);MADS-box;基因家族;表达模式

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《分子植物育种》印刷版
• 第 18 卷
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