杜红艳 , 庞胜群^* , 王海琪 , 张中荣 , 马海翔

石河子大学农学院, 特色果蔬生理与种质资源利用兵团重点实验室, 石河子, 832003
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 5 篇   
收稿日期: 2019年09月11日    接受日期: 2019年09月16日    发表日期: 2020年11月04日

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typeⅡ型 MADS-box 基因家族在控制植物开花和花器官形成方面起着非常重要作用。近几年对MADS-box 基因家族的研究颇多，但在番茄中的相关研究鲜有报道。本研究利用生物信息学的手段，对番茄typeⅡ型 MADS-box 基因家族蛋白序列进行分析，预测其结构域、蛋白的二级结构、三级结构、分子量、等电点、保守基序和染色体位置等特征，并用 MEGA 5.05 与拟南芥蛋白进行比对分析并构建系统进化树。结果表明，番茄 type域型 MADS-box 基因家族有 32 个成员，分为 MIKCC (30)组和 MIKC* (2)组，MIKCC 组可进一步分为 SEP (6)、AGL6 (1)、AP1-FUL (5)、FLC (1)、SOC1 (3)、AGL17 (3)、SVP (2)、BS (1)、AG (3)、AGL12 (1)、AP3-PI (4)等 11 个亚族。typeⅡ型 MADS-box 家族基因在染色体上的分布不均匀，大多数聚集在 2 号染色体上，在第 9 号和 10 号染色体上没有分布。蛋白大小在 177~279 aa，分子量和等电点分别介于 20 703.9~30 846.96 和 5.98~9.79 之间；基序预测有 20 个保守基序，α- 螺旋和无规则卷曲是主要的二级结构。基因结构显示内含子在 5~9 之间。通过进化树可以看出大部分基因参与调控花器官的特异性。这为深入研究番茄typeⅡ型 MADS-box 基因提供参考依据。 

番茄；MADS-box；转录因子家族；生物信息学