玉林师范学院生物与制药学院, 玉林, 537000
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 10 篇
收稿日期: 2019年09月10日 接受日期: 2019年09月16日 发表日期: 2020年11月04日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 10 篇
收稿日期: 2019年09月10日 接受日期: 2019年09月16日 发表日期: 2020年11月04日
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摘要
磷脂酰乙醇胺结合蛋白(phosphatidyl ethanolamine binding protein, PEBP)在控制花的发育和形成过程中起着重要作用,为了解茶树 PEBP 基因家族在茶树开花中的作用,本研究利用生物信息学方法从茶树基因组数据库中检索出了 7 个 PEBP 基因,并对其蛋白质理化性质、基因结构、进化关系、保守功能域、启动子顺式作用元件和表达模式进行了分析。结果表明,茶树 PEBP 基因编码的氨基酸数相对较少,分子量较小,主要介于 14.39~20.19 kD 之间,大部分为碱性蛋白;对茶树 PEBP 基因结构进行分析,发现该基因家族中有6个成员具有 4 个外显子及 3 个内含子的结构,基因结构比较保守;系统进化分析发现,茶树 PEBP 基因家族可以分为 FT、TFL1、MFT 亚基因家族,每个亚族所含有的基因数分别为 1 个、3 个、3 个,编码的蛋白序列均含有 motif 1、motif 3、motif 4 等保守基序;启动子元件分析的结果显示,PEBP 基因的启动子元件类型主要以光响应元件及激素响应元件为主;分析茶树 PEBP 基因家族在不同组织的表达情况,发现其主要存在 3 种类型的表达模式,其中 MFT-like 亚家族的基因 CsMFT 与 CsMFT2 在生殖器官及营养器官都具有非常高的表达量。本研究获取了茶树 PEBP 基因家族成员的序列和部分功能信息,为进一步研究 PEBP 基因家族参与茶树开花调控的分子机制提供了参考。
关键词
茶树(Camellia sinensis);PEBP 基因家族; 启动子;顺式元件;表达量分析
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