研究报告

绿豆AP2/ERF转录因子家族的生物信息学鉴定与特征分析  

陈珂1 , 张君1 , 刘嘉斐 2 , 杨洁冰1 , 李蒙鑫1 , 陈吉宝 1 , 杨树琼1*
1 南阳师范学院, 南水北调中线水源区水安全河南省协同创新中心, 河南省南水北调中线水源区生态安全重点实验室, 南阳, 473061; 2 南阳师范学院, 河南省伏牛山昆虫生物学重点实验室, 南阳, 473061
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 4 篇   
收稿日期: 2019年09月02日    接受日期: 2019年09月06日    发表日期: 2020年11月04日
© 2020 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台
这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用,版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。
摘要

 AP2/ERF 转录因子是一种在植物生长发育和()生物胁迫应答等过程中发挥重要作用的转录因子家族。本研究在绿豆全基因组范围内,利用生物信息学方法分析了 AP2/ERF 转录因子家族的成员、结构功能和理化性质等信息。结果表明:绿豆 AP2/ERF 转录因子家族包含 87 个成员,划分为 ERFDREBAP2 RAV 亚家族,其中 76 个成员不均匀的分布在 11 条染色体上;不同亚家族基因结构差异较大,除高度保守的AP2/ERF 结构域外还存在其它保守结构域;各成员的蛋白分子量介于 13.99~75.40 kD,理论等电点介于4.87~9.72,可能不存在信号肽且均属于亲水性蛋白;- 螺旋和无规则卷曲是主要的二级结构元件,三级结构与二级结构预测结果基本一致;丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸是主要的磷酸化作用位点,不同成员具有不同数量和长度的固有无序化区域。本研究结果将为进一步研究绿豆 AP2/ERF 转录因子功能提供理论依据,同时也为绿豆品种抗逆改良提供了依据。 
 

关键词
绿豆;AP2/ERF 转录因子;生物信息学分析

HTML格式版本正在制作中。
《分子植物育种》印刷版
• 第 18 卷
阅览选项
. 全文 PDF
. 全文 HTML
读者评论
. 评论
作者的其他论文
.
陈珂1
.
张君1
.
刘嘉斐 2
.
杨洁冰1
.
李蒙鑫1
.
陈吉宝 1
.
杨树琼1*
相关论文
.
绿豆
.
AP2/ERF 转录因子
.
生物信息学分析
服务
. 发表评论