研究报告

红掌佛焰苞转录组测序数据组装及基因功能注释  

林发壮1* , 姚凤琴1 , 安慧珍2 , 陈昌铭1 , 郭芸玮1 , 林辉锋1 , 夏朝水1 , 钟琳珊1
1三明市农业科学研究院,三明, 365509; 2厦门市农业技术推广中心,厦门, 361009
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 4 篇   
收稿日期: 2019年08月23日    接受日期: 2019年08月30日    发表日期: 2020年10月29日
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摘要

为了获得红掌转录组数据及预测佛焰苞颜色差异关键基因功能。本研究以红色和粉色‘阿拉巴马’红掌的佛焰苞为材料,通过 Illumina HiSeqTM 2000高通量测序技术平台进行转录组测序,获得 28 219 907Raw reads,组装后将 All-UnigeneNRNTPFAMKOG/COGSwiss-ProtKO/KEGGGO数据库比对,共有 138 696Unigene对应的功能信息,其中 37 073Unigene被注释到 NR数据库,显示与油棕、海枣等物种具有一定的相似性;有 14 586条被注释到 KOG数据库,根据功能将其分为 26类;有 30 580Unigene获得 GO注释信息,根据 GO功能分为三大类,包含 57个功能分支;有 14 326Unigene被注释到KEGG代谢途径中,分属于 32个代谢通路,包括苯丙素的生物合成、谷胱甘肽代谢、苯丙氨酸代谢、ABC转运蛋白、类黄酮生物合成,其中黄酮和黄酮醇的生物合成和异黄酮生物合成等与花青素代谢密切相关。本研究结果对红掌佛焰苞花色苷形成相关基因的研究及分子标记开发等研究有一定指导意义。
 

关键词
红掌(Anthurium andraeanum L.);花色苷;转录组测序;功能测序

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《分子植物育种》印刷版
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