研究报告

谷子 TCP 基因家族成员序列特征及表达模式分析  

连卜颍1,2 , 王喆1,2 , 韩尚玲1,2 , 侯思宇1,2,3 , 韩渊怀1,2,3* , 李红英1,2,3
1 山西农业大学农学院, 太谷, 030801; 2 山西农业大学, 农业生物工程研究所, 太谷, 030801; 3 山西农业大学, 杂粮种质资源发掘与遗传改良山西省重点实验室, 太谷, 030801
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 3 篇   
收稿日期: 2019年08月22日    接受日期: 2019年09月27日    发表日期: 2020年04月29日
© 2020 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台
这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用,版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。
摘要

为深入解析谷子 TCP 基因家族的功能,通过生物信息学方法对谷子 TCP 转录因子家族基因成员序列特征、基因结构、染色体定位、系统进化关系及表达模式进行分析。结果表明:除第 8 染色体之外,从谷子基因组上其余 8 条染色体中共鉴定出 26 TCP 家族成员,并根据其在染色体的顺序和位置先后进行命名,其中分布在第 3 和第 5 染色体上的 TCP 家族成员数量最多,高达 5 个。不同家族成员其编码的氨基酸残基数目具有明显差异,范围为 95 aa~451 aa。其中 SiTCP21 基因编码氨基酸残基数目最少为 95 个氨基酸;而SiTCP15 最多为 451 个氨基酸残基。26 TCP 家族成员的蛋白结构中均含有 bHLH 保守结构域。基因表达分析结果表明,31%的成员在穗中的表达量明显高于其他组织,因此推测该基因家族可能对谷子穗部生长发育的调控起关键作用。本研究对深入研究 SiTCPs 家族基因的功能奠定了基础,也为谷子生长发育的调控机制提供了新的思路。

关键词
谷子(Setaria italica);TCP;转录因子;生物信息学分析;基因表达分析

HTML格式版本正在制作中。
《分子植物育种》印刷版
• 第 18 卷
阅览选项
. 全文 PDF
. 全文 HTML
读者评论
. 评论
作者的其他论文
.
连卜颍1,2
.
王喆1,2
.
韩尚玲1,2
.
侯思宇1,2,3
.
韩渊怀1,2,3*
.
李红英1,2,3
相关论文
.
谷子(Setaria italica)
.
TCP
.
转录因子
.
生物信息学分析
.
基因表达分析
服务
. 发表评论