研究报告

紫花苜蓿 GLKG34 转录因子的生物信息学和表达分析  

袁玉莹 , 宋婷婷 , 项继红 , 孙雪 , 喻金秋 , 尹航 , 崔国文*
东北农业大学动物科学技术学院, 哈尔滨, 150030
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 18 篇   
收稿日期: 2019年07月24日    接受日期: 2019年08月01日    发表日期: 2020年09月17日
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摘要

GLK 基因家族是植物特有的转录因子,在调节叶绿体发育中起着重要作用。为了进一步研究 GLK基因家族中 GLKG34 转录因子的基本特征以及在胁迫下的响应情况,本研究在基因组范围内,利用生物信息学方法对苜蓿的 GLKG34 转录因子分布、结构和功能等进行分析。结果预测表明:苜蓿 GLKG34 转录因子位于苜蓿第六条染色体,编码 384 个氨基酸残基,有亲水性,定位于细胞核。在蛋白质二级结构预测中,无规则卷曲与α 螺旋占比较大。同源比对结果显示:与菜豆亲缘关系最近,与玉米等禾本科亲缘关系较远。通过顺势作用元件预测发现:该基因 2 000 bp 启动子序列中存在许多非生物胁迫响应元件,推测其对逆境胁迫有调节作用。对干旱、盐、碱及冷胁迫下的荧光定量分析表明:GLKG34 对盐碱有明显响应。本研究为紫花苜蓿中 GLKG34 转录因子的功能解析及耐性基因的挖掘提供了一定的参考依据。
 

关键词
紫花苜蓿;转录因子;生物信息学分析;表达分析

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《分子植物育种》印刷版
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