赵兴奎^1* , 范昕琦^2* , 聂萌恩² , 王海燕² , 柳青山² , 段永红¹

1 山西农业大学农学院, 太谷, 030801; 2 山西省农业科学院高粱研究所, 高粱遗传与种质创新山西省重点实验室, 晋中, 030600
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 3 篇   
收稿日期: 2019年07月22日    接受日期: 2019年08月21日    发表日期: 2020年07月15日

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WRKY 转录因子是调控植物生长发育的重要转录因子，本研究利用高粱基因组数据库(v3.1.1)，通过生物信息学分析鉴定出 97 个高粱 WRKY 基因家族成员，其 CDS 序列长度为 423~4 965 bp，编码氨基酸长度为 141~1 655 aa。染色体定位发现 97 个基因不均匀地分布于 10 条染色体上，其中 3 号染色体上数目最多，有 23 个 WRKY 基因，6 号染色体最少，只有 5 个 WRKY 基因。根据 WRKY 保守结构域和锌指结构的特点对 97 个转录因子进行分类，可将它们分为玉、域和芋三大类，分别有 11 个、70 个和 16 个成员。另外对WRKY 蛋白保守基序分析发现 WRKY 结构域有 3 个保守基序组成，各组成员的保守基序基本一致。部分蛋白的 WRKY 保守域和锌指结构具有多样性，分析发现部分高粱 WRKY 蛋白的 WRKYGQK 结构域中‘Q’突变为‘E’、‘S’和‘K’。系统进化关系显示高粱域、芋类 WRKY 转录因子类聚在玉的下级分支上，表示域和芋类可能是由玉类进化而来的。

高粱(Sorghum bicolor)；WRKY 转录因子；系统进化；生物信息学分析