研究报告

马蹄CCoAOMT基因的克隆与表达分析  

陈夏鑫1,2 , 陈振林1,2 , 帅良1 , 段振华1,2 , 商飞飞1 , 宋慕波1*
1 贺州学院, 食品科学与工程技术研究院, 贺州, 542899; 2 大连工业大学食品学院, 大连, 116034
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 14 篇   
收稿日期: 2019年07月07日    接受日期: 2019年07月10日    发表日期: 2020年11月04日
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摘要

咖啡酰辅酶 -A-O- 甲基转移酶(CCoAOMT)是植物木质素合成的关键酶之一。为探明 CCoAOMT 在荸荠木质素单体合成过程中的作用,本研究利用 RACE 技术在荸荠球茎中克隆 CCoAOMT 基因的全长序列,并对其在不同组织和鲜切荸荠贮藏过程中的表达进行分析。结果表明,克隆得到荸荠 CCoAOMT 基因 cDNA全长 1 302 bp,将此基因命名为 CwCCoAOMT,其 GenBank 登录号为 MG719240。该序列包含一个 786 bp 的最大开放阅读框,可编码 261 个氨基酸,其 DNA 中包含 个内含子和 个外显子。该蛋白的分子量为 29.17 kD,理论等点为 5.21CCoAOMT 蛋白二级结构中 α- 螺旋占 37.55%,无规则卷曲占 35.63%,延伸链占 19.16%,β- 折叠结构占 7.66%。序列比对和系统进化树分析表明,CwCCoAOMT 蛋白与其它植物 CCoAOMT 蛋白序列相似度较高,其中与慈竹的亲缘关系最近。通过各组织表达特性分析发现,CwCCoAOMT 在荸荠皮中的表达最高,在荸荠肉中的表达最低。在鲜切荸荠贮藏过程中 CwCCoAOMT 的表达呈快速上升趋势,而水杨酸处理能显著抑制 CwCCoAOMT 表达上升。本实验结果可为控制鲜切荸荠黄化的研究提供理论依据。 
 

关键词
荸荠(Eleocharis dulcis);CCoAOMT 基因;基因克隆; 生物信息学分析;表达分析

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《分子植物育种》印刷版
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