研究报告

橡胶草SRPP5 基因的克隆及生物信息学分析  

黄岭1 , 黄俊1 , 江羽宸1 , 张浩2* , 闫洁1*
1 石河子大学生命科学学院, 石河子, 832003; 2 新疆林业科学院园林绿化研究所, 乌鲁木齐, 830000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 15 篇   
收稿日期: 2019年06月27日    接受日期: 2019年07月08日    发表日期: 2020年07月31日
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摘要

天然橡胶是产胶植物中合成的聚异戊二烯高分子化合物,而小橡胶粒子蛋白是橡胶粒子膜上参与天然橡胶分子链延伸的关键因子,与橡胶的产量和质量密切相关。本研究利用 PCR技术从橡胶草中克隆得到TkSRPP5 基因全长序列并进行生物信息学分析。结果表明,该基因含有一个长度为 654 bp的开放阅读框,并编码 217个氨基酸,所编码蛋白的分子量为 23.31 kD,理论等电点为 4.58TkSRPP5为亲水性蛋白,具有 24个磷酸化位点,亚细胞定位预测在细胞质中。该蛋白属于 SRPP家族,二级结构主要存在- 螺旋和无规则卷曲结构,与预测的蛋白质三级结构一致。系统进化树分析表明,该蛋白与菊苣的 SRPP蛋白有着最近的亲缘关系。本研究为进一步了解TkSRPP5 基因的功能和其在橡胶草胶乳合成中的作用机制提供了理论依据。
 

关键词
橡胶草(Taraxacum kok-saghyz);小橡胶粒子蛋白;基因克隆;生物信息学分析

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《分子植物育种》印刷版
• 第 18 卷
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