浙江省农业科学院蔬菜研究所, 杭州, 310021
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 5 篇
收稿日期: 2019年06月19日 接受日期: 2019年06月28日 发表日期: 2020年09月08日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 5 篇
收稿日期: 2019年06月19日 接受日期: 2019年06月28日 发表日期: 2020年09月08日
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摘要
菜心在长日照或短日照条件下均可抽薹开花,为解释菜心开花对光周期不敏感的分子机制,本研究以‘四九菜心’为材料,利用菜心叶片转录组测序数据鉴定了光敏色素 B 基因(BcPHYB)。通过构建系统树,发现菜心 BcPHYB 类似于早花大白菜 BraPHYB2,并且在 5’UTR 中存在 20 bp 的 InDel。菜心 BcPHYB 在pre-mRNA 加工中存在着选择性剪接,一部分转录本会保留 1 号、2 号或 3 号内含子,导致相应的 BcPHYB蛋白产物中插入或者缺失部分氨基酸序列片段。本研究分析了菜心 BcPHYB 的 InDel 变异与选择性剪接情况,为阐释菜心对光周期不敏感的开花分子机制提供了帮助。
关键词
菜心(Brassica parachinensis);BcPHYB;InDel 变异;选择性剪接
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