刘蕊^1,3 , 董宇飞⁴ , 刘乃新^1,2* , 吴玉梅¹

1 黑龙江大学农作物研究院，哈尔滨 150080; 2 东北林业大学园林学院, 哈尔滨, 150080; 3 青海大学农牧学院, 青海省农林科学院土壤肥料研究所, 西宁, 810016; 4 黑龙江大学生命学院, 哈尔滨, 150080
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《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 22 篇   
收稿日期: 2019年06月10日    接受日期: 2019年06月19日    发表日期: 2020年08月27日

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甜菜是一种重要的糖料作物，占世界糖来源的 1/3。甜菜品种改良的主要障碍是其遗传变异小、遗传资源有限。在本研究中，我们使用限制性位点相关 DNA (restriction-site-associated DNA, RAD)测序技术，在全基因组范围内搜寻 20 种甜菜基因型的 SNPs 和 SSRs。根据有效限制性酶切片段(restriction fragment, RF)的 GO 注释，发现 7 144 个与“生物过程”有关，4 378 个与“细胞组份”有关，3 763 个与“分子功能”有关。采用多重比对方法，鉴定出甜菜含有 38 884 682 SNP 位点。这些 SNP 成功地揭示了甜菜基因型间的遗传关系。此外，在 RAD 酶切序列中也鉴定出了 17 916 个 SSR 位点。甜菜基因组中最常见的 SSR 序列为二核苷酸(6 019, 33.60%)，其次是单核苷酸 4 321 (24.11%)，再次是三核苷酸 3 597 (20.07%)。RAD 测序技术使甜菜分子标记的快速全基因组发现成为可能。本研究所鉴定的大量 SNP 和 SSRs 位点，对构建甜菜高密度遗传连锁图谱、QTL 分析、标记辅助选择和比较研究具有重要意义。
 

甜菜(Beta vulgaris L.)；限制性位点相关 DNA；SNP；遗传多样性