研究报告

火龙果 HuICE1 基因的克隆与表达分析  

陈翠1 , 王卓2 , 谢碧玉2 , 任陪娣2 , 徐碧玉2 , 金志强2 , 黄绵佳3 , 从心黎3
1 海南大学园艺学院, 热带生物资源教育部重点实验室, 海口, 570228; 2 中国热带农业科学院热带生物技术研究所, 农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室, 海口, 571101; 3 海南大学生命科学与药学院, 海口, 570228
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 12 篇   
收稿日期: 2019年05月28日    接受日期: 2019年06月20日    发表日期: 2020年02月12日
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摘要

本研究以‘金都一号’红心火龙果(Hylocereus undatus)为实验材料,利用 ICE 序列 3' 端的高度保守结构域(bHLH),采用同源克隆法从火龙果果肉中分离得到一条 HuICE1 序列,其 cDNA 序列全长 1 673 bp,具有一个 1 596 bp 的完整开放阅读框,生物信息学分析显示该基因编码的蛋白定位于细胞核,为水溶性蛋白。蛋白结构预测发现,HuICE1 蛋白属 MYC2 型转录因子,在 3' 端第 340~384 个氨基酸含有高度保守的bHLH 结构域,表明 HuICE1 基因属 bHLH 家族,还有核定位信号(NLS)区、富 S 区、转膜区、类泛素化(SUMO)结合位点各 1 个。同源性分析表明,火龙果与甜菜(Beta vulgaris)的核苷酸序列相似度最高,为 85.10%qRT-PCR 表达分析表明,在火龙果各个组织中 HuICE1 均有表达,说明该基因是组成型表达,此研究为后续研究火龙果抗逆机制提供理论依据。

关键词
火龙果(Hylocereus undatus);HuICE1;基因克隆;表达分析

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《分子植物育种》印刷版
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