研究报告

基于SNP和SSR分子标记的番茄种质资源遗传多样性分析  

王涛1 , 扈艳萍2 , 朱华1 , 张子君1 , 邹庆道1*
1 辽宁省农业科学院蔬菜研究所, 沈阳, 110161; 2 辽宁职业学院农艺学院, 铁岭, 112000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 36 篇   
收稿日期: 2019年05月10日    接受日期: 2019年05月17日    发表日期: 2020年08月28日
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摘要

为分析不同番茄种质的遗传多样性,利用 120 SNP 29 SSR 标记对 210 份番茄自交系进行基因分型。结果表明,SSR 具有较高的多态性,而 SNP 检测到更高的基因多样性。在预先划分的 3 个亚群中,樱桃番茄遗传变异最高,常规番茄品种次之,现代番茄品系最低,说明早期育成的番茄品种仍具有较为丰富的遗传多样性。群体结构分析发现,SNP 可将 3 个亚群区分开,同时常规番茄进一步分为粉果番茄和红果番茄 2 个小亚群。SSR 的分析结果与 SNP 和预先的分类并不一致,未能将常规番茄和现代品系完全区分开。遗传距离分析显示,SNP 具有更高的分辨率,可以区分所有供试材料,有 6 对材料组合未被 SSR 数据区分开。总的来说,在栽培番茄遗传多样性分析中,SNP 标记具有更高的效率。
 

关键词
番茄;遗传多样性;SNP;SSR

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《分子植物育种》印刷版
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