研究报告

草地早熟禾硝酸盐转运蛋白 NRT1/PTR FAMILY 5.8 基因的克隆及生物信息学分析  

陈阳 , 金一锋 , 张学通 , 刘宇琦 , 林媛媛 , 张博学
齐齐哈尔大学生命科学与农林学院, 抗性基因工程与寒地生物多样性保护黑龙江省重点实验室, 齐齐哈尔, 161006
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 19 篇   
收稿日期: 2019年05月08日    接受日期: 2019年06月17日    发表日期: 2020年07月15日
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摘要

硝态氮是植物主要的氮素营养来源,与植物的生长发育与抗性能力密切相关。硝态氮的吸收与运转对提高植物氮素利用效率有调控作用,其中硝酸盐转运蛋白发挥重要作用。本研究通过 RT-PCR 的方法克隆得到草地早熟禾硝酸盐转运蛋白 NRT1/PTR FAMILY 5.8 基因的编码区序列,并进行生物信息学分析。结果表明,该基因编码区长度为 1 434 bp,共编码 477 个氨基酸。NRT1/PTR FAMILY 5.8 蛋白分子量为 51.7 kD,等电点为 4.9NRT1/PTR FAMILY 5.8 蛋白共有 8 个跨膜结构域,3 个糖基化,位点无信号肽,预测定位于质膜或内质网中。NRT1/PTR FAMILY 5.8 蛋白含有结构域 PTR2 属于 MFS 蛋白超家族。草地早熟禾 NRT1/PTR FAMILY 5.8 蛋白与二穗短柄草,粗山羊草的相似度较高,而且不同物种之间的 NRT1/PTR FAMILY 5.8NRT1/PTR FAMILY 5.9 的同源进化关系较近。本研究为进一步研究 NRT1/PTR FAMILY 5.8 基因的功能及硝酸盐转运途径具有重要意义。

关键词
草地早熟禾;NRT1/PTR FAMILY 5.8;基因克隆;生物信息学

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《分子植物育种》印刷版
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