研究报告

基于分子标记的栽培番茄遗传多样性与遗传结构分析  

周艳朝 , 蒋芳玲 , 刘帅 , 吴震
南京农业大学园艺学院,农业农村部华东地区园艺作物生物学与种质创新重点实验室, 南京, 210095
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 20 篇   
收稿日期: 2019年04月30日    接受日期: 2019年05月31日    发表日期: 2020年06月22日
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摘要

为分析国内外收集的栽培番茄间的遗传多样性,了解其亲缘关系,本研究选择 31 对 InDel 标记与 10对SSR标记对96份国内外栽培番茄种质资源进行遗传多样性和遗传结构分析。结果表明,共检测到 87个 等位基因,平均每个位点等位基因数为 2.122 个;主等位基因频率变化范围为 0.589~0.995,平均值为 0.874; 基因多样性指数变化范围为 0.010~0.496,平均值为 0.200;多态性信息含量为 0.010~0.404,平均为 0.172。 96份栽培番茄种质资源间的遗传距离为 0.012~0.728,平均遗传距离为 0.216。通过聚类分析,将 96份栽培番 茄材料在遗传距离为 0.306时划分为三个类群。通过遗传结构分析,在 K=3时,将 96份栽培番茄划分为三 个群体,两种类群划分有相似的结果。聚类分析和遗传结构分析结果表明,来自不同国家的栽培番茄混杂分 布,具有相似的遗传背景, 96份栽培番茄种质资源的类群划分与其地理来源之间无直接关系。该研究可为栽 培番茄种质资源的有效利用、亲本选择和新品种的遗传改良提供依据。

关键词
分子标记;栽培番茄;遗传多样性;遗传结构

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