四川农业大学农学院,成都, 611130
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 11 篇
收稿日期: 2019年04月30日 接受日期: 2019年05月31日 发表日期: 2020年06月22日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 11 篇
收稿日期: 2019年04月30日 接受日期: 2019年05月31日 发表日期: 2020年06月22日
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摘要
根据课题组前期转录组文库信息获得的红花热胁迫相关转录因子 Unigene 的全长序列,设计引物
并克隆该基因,采用生物信息学方法对其氨基酸序列的理化性质、系统发育、蛋白质亚细胞定位、结构域及跨
膜区域等进行预测和分析。此外,试验还采用 RT-qPCR 方法分析该基因在红花各组织包括根、茎、叶、花及
4个不同发育时期的种子中的表达情况。结果发现,所获序列全长 1 326 bp,可编码 441个氨基酸,相对分子
质量 50.41 kD。其中,最丰富的氨基酸为亮氨酸(Leu),带正电残基 64个,带负电残基 75个。信号肽及亚细胞
定位揭示该基因不存在明显信号肽且该基因属细胞核定位。 SMART分析表明该基因具有典型 HSF结构域。
进化树分析表明,该序列与热激转录因子 HSFA9基因相似度较高,与刺菜蓟的亲缘关系最近, 因此可将其命
名为 CtHSFA9。荧光定量 PCR分析表明 CtHSFA9 基因在红花根组织中相对表达量最高,叶次之,花中最低。
在不同发育时期种子中,以花后 18 DAF (Day after flower)中表达量最高, 22 DAF次之,在 14 DAF表达量最
低。本研究初步明确了红花 CtHSFA9 基因的结构特点和进化关系,其属于 HSF热激转录因子家族,可为后
续开展红花逆境相关转录因子的机理研究做铺垫,同时也为植物抗逆性状的改良提供研究基础。
关键词
红花(Carthamus tinctorius);CtHSFA9;基因克隆,表达分析
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