研究报告/Research Report

松属EST-SSR引物开发及马尾松-湿地松种间特异性鉴别引物筛选  

贾婕1 , 冯源恒1 , 杨章旗1* , 黄永利2
1 广西壮族自治区林业科学研究院, 南宁, 530002;
2 广西壮族自治区南宁市林科所, 南宁, 530107
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2014 年, 第 12 卷, 第 17 篇   doi: 10.13271/j.mpb.012.000963
收稿日期: 2013年11月14日    接受日期: 2014年02月26日    发表日期: 2014年07月19日
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推荐引用:

Jia J., Feng Y.H., Yang Z.Q., and Huang Y.L., 2014, TEST-SSR Primer Development for Pinus and Primers Selection for Interspecies-specific Identification between P. massoniana and P. elliottii, Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 12(5): 963-968 (贾婕, 冯源恒, 杨章旗, 黄永利, 2014, 松属EST-SSR引物开发及马尾松-湿地松种间特异性鉴别引物筛选, 分子植物育种, 12(5): 963-968) 

摘要

为了开发松属SSR标记,本研究从NCBI的dbEST数据库中共下载889 964条松属EST序列,处理最新的280 000条,经过去冗余处理和SSR位点搜索,获得了248条备选EST序列并进行引物设计。通过检测发现有44对引物在马尾松中有扩增产物,其中13对具有多态性;39对在湿地松中有扩增产物,9对具有多态性。经进一步筛选得到扩增产物稳定、清晰且种内高度一致、种间差异明显的引物15对,其中PJ164引物作为马尾松与湿地松种间鉴定较为合适。这批引物对于马尾松、湿地松分子育种研究及种间杂交子代鉴定具有较大的应用价值。

关键词
松属;EST-SSR;引物开发;马尾松;湿地松

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《分子植物育种》印刷版
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