研究报告

紫花苜蓿III型几丁质酶基因同源克隆与序列变异分析  

桂枝 , 高建明 , 卢树昌*
天津农学院农学与资源环境学院, 天津, 300384
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 14 篇   
收稿日期: 2019年04月26日    接受日期: 2019年05月03日    发表日期: 2020年08月23日
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摘要

型几丁质酶(chitinase Ⅲ, Chi )是植物重要的防卫蛋白之一,可阻止病原菌的侵入和发展,抑制特定病害的发生,在植物抵抗病原菌的过程中具有重要作用。为了分离苜蓿 Chi 基因的基因组序列,进而分析其序列变异情况,本研究采用同源克隆法,从 16 个紫花苜蓿(Medicago sativa)品种的集群 DNA 中分离了 9 个属于 a 类的 Chi Ⅲ基因(Chi Ⅲ a)的部分基因组编码序列,分别与蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)9 Chi Ⅲ a 基因相对应,将其命名为 chit3-1-1chit3-1-2chit3-1-4chit3-1-5chit3-1-6chit3-1-9chit3-1-10chit3-1-11 chit3-1-12。序列变异分析显示:chit3-1-1chit3-1-2chit3-1-5chit3-1-9chit3-1-10chit3-1-11 chit3-1-12 7 个基因的单核苷酸多态性(SNP)位点间的平均距离分别为 28 bp27 bp648 bp55 bp64 bp130 bp 131 bp,差异较大。表明 chit3-1-5 序列高度保守,chit3-1-11 chit3-1-12 比较保守,chit3-1-9 chit3-1-10 变异中等,而 chit3-1-1 chit3-1-2 的变异较大。从总体看,在苜蓿基因组中 Chi Ⅲ a基因的序列较为保守。本试验为进一步对 Chi Ⅲ基因进行关联分析等遗传学研究和 cDNA 全长克隆等分子生物学研究提供了良好的基础。
 

关键词
紫花苜蓿(Medicago sativa);芋型几丁质酶;同源克隆;基因组序列分离

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