延安大学生命科学学院, 陕西省红枣重点实验室, 延安, 716000
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 11 篇
收稿日期: 2019年04月25日 接受日期: 2019年05月22日 发表日期: 2020年06月24日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 11 篇
收稿日期: 2019年04月25日 接受日期: 2019年05月22日 发表日期: 2020年06月24日
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摘要
为了研究枣树枣疯病发生的分子机理,基于边合成边测序技术,本研究使用 Illumina 高通量测序平台对健康及感病的木枣树叶片进行转录组测序分析。经过测序质量控制,共得到 Clean Data 55.17 Gb ,各样品 Clean Data 平均为 6.13 Gb,GC%含量为 45.43%,Q30>93.63%,与参考基因组的比对效率在 78.41%~85.77%之间,共发掘 1 909 个新基因。样品间共筛选出 9 593 个差异表达基因,其中上调基因有 6 199 个,下调基因有 3 394 个。同时,还预测出 1 298 个转录因子,归于 55 类转录因子,其中 AP2-EREBP 家族、MYB 家族、bHLH 家族和 C2H2 家族最多,分别有 112 个、90 个、90 个和 85 个。健康木枣与感病木枣(ML vs.WL)注释到各数据库的差异表达基因数(4 755)明显多于其它两个样品组。各样品组间差异表达基因显著富集在黄酮类化合物、苯丙烷类化合物和不饱和脂肪酸生物合成途径,以及植物激素信号转导、淀粉和蔗糖代谢和脂肪酸代谢等代谢通路。该转录组测序分析为寻找枣疯病相关基因提供理论参考。
关键词
枣疯病;转录组;高通量测序;差异表达基因
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