重庆市中药研究院,中国中医科学院中药资源中心重庆分中心, 重庆市中药良种选育与评价工程技术研究中心,重庆, 400065
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 16 篇
收稿日期: 2019年04月23日 接受日期: 2019年05月27日 发表日期: 2020年06月22日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 16 篇
收稿日期: 2019年04月23日 接受日期: 2019年05月27日 发表日期: 2020年06月22日
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摘要
为研究栀子中环烯醚萜类物质生物合成的分子机制,本研究以药用植物栀子果实为研究材料,利用 Illumina HiSeq 4000对栀子进行转录组测序,利用 Trinity软件对测序结果进行 De novo 组装,使用 BLAST 软件对Unigene进行分类、功能注释,通过 MISA软件分析 SSR位点。共组装获得 75 539条 Unigene,平均长 度 1 614 bp,在数据库的注释成功率为 100%,共搜索到 50 571 个 SSR 位点,发现栀子转录组中有 1 294 个 Unigene参与到 16个与栀子次生代谢物质生物合成的代谢通路中,其中有 77个参与环烯醚萜类物质生物 合成。本研究初步获得栀子中参与环烯醚萜类物质合成的功能基因,不仅为开展栀子功能基因的鉴定和克隆 提供基础序列,还为后续开展栀子药效成分生物合成的分子机制提供依据。
关键词
栀子(Gardeniae fructus);转录组;环烯醚萜类
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